曹国伟张
Assistant Professor, Computational Biomedicine, Chobanian & Avedisian School of Medicine
- 教育
- Computer Science, PhD, University of Missouri
Statistics, MS, University of Missouri
Computer Science, MS, University of Missouri
Automation, BS, Beijing Institute of Technology - 办公室
- 东协和街72号
- 电子邮件
- chz2009@bu.edu
- 电话
- (573) 289 - 3632
As an interdisciplinary researcher, 曹国伟张 has a background in systems biology, statistics, machine learning, software engineering, and especially in next-generation sequencing analysis, such as ChIP-Seq, WGS, WES, RRBS, RNASeq, ATACSeq, and Single-cell RNA sequencing.
他目前的新濠影汇线上赌场研究重点是干细胞和癌症基因组学。
在与Lorenz Studer博士的团队合作中，Zhang提出了一个令人惊讶的发现，即操纵培养基的营养成分可以显著改变hPSC的多能状态。 通过对多层分子数据的综合分析，该团队证明无脂培养条件足以通过内源性ERK抑制将人类多能干细胞维持在幼稚到启动的中间状态，而补充脂质可以将细胞推向启动细胞状态（cell stem cell, 2019）。 在衰老和神经元退行性疾病的新濠影汇线上赌场研究方面也投入了大量的精力。
虽然新濠影汇线上赌场研究微生物群与疾病之间的关系在过去几年中非常流行，但由于缺乏临床样本和量化当地微生物群的技术挑战，大多数新濠影汇线上赌场研究仅限于肠道微生物组，并且它们的功能被简单地忽视和低估。 Zhang展示了一种新的计算管道，可以从小型临床内镜活检的测序数据中掌握公正的局部微生物组检测的挑战（Genome biology, 2015）。 他从非癌症人群中收集了50份胃癌样本和106份胃内窥镜活检，这是迄今为止进行的最大规模的非癌症胃基因组学新濠影汇线上赌场研究。 除了微生物组表征外，Zhang还从大量和单细胞RNASeq数据中量化了上述样品的免疫浸润。 通过整合来自我们的样品和TCGA GI-tract新濠影汇线上赌场研究的多层数据，他发现免疫标记物的表达与局部微生物组多样性之间存在很强的相关性，表明局部微生物组对于塑造肿瘤微环境可能非常重要。